혈액기반 생체 검사를 위한 고민감도 표적 유전자 선별 키트 개발

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과제고유번호 1415156727 당해연도 연구기간 2018-01-01 ~ 2019-02-28
과제년도 2018 총연구기간 2016-10-01 ~ 2019-02-28
사업명 포스트게놈신산업육성을위한다부처유전체사업(R&D)(산업부)
과제명 한글 혈액기반 생체 검사를 위한 고민감도 표적 유전자 선별 키트 개발
영문 The development of kit for screening of cancer related target genes with high sensitivity in the liquid biopsy
주관부처명 한국산업기술평가관리원 과제관리기관명 한국산업기술평가관리원
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연구기관명 주식회사 시선바이오머티리얼스 기초자치단체
연구개발단계 응용연구 연구수행주체 중소기업
세부과제지원코드 0102 지역 대전
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6T관련기술코드 BT(생명공학기술) / 보건의료관련응용 / 난치성 질환치료기술 과학기술 표준 분류 의약품/의약품개발기술 / 시약/진단제 / 보건의료
연구목표 가. 주관기관 (주식회사 시선바이오머티리얼스) : o 적용 가능한 2개의 NGS 플렛폼에 대한 최적화 확립 o 상용화를 위한 Prototype 제품 완성 o 임상검체를 통한 Prototype 제품의 보완작업 수행 o 고민감도 NGS 분석 키트 활용 시스템 구축 나. 참여기관 (주식회사 파나진) : o 표적유전자 선별 프로브 대량생산 기술 확보 o 선별 프로브의 대량생산 및 SOP 확립 다. 참여기관 ((주) 인실리코젠) : o 자원변동형 클라우드 기반 NGS 분석시스템 개발 o GridFTP 기반의 데이터 전송 모듈 개발 o 임상 활용이 가능한 리포트 생성 시스템 개발 라. 참여기관 (가톨릭대학교 산학협력단 / 건국대학교병원) : o 임상샘플을 이용한 개발키트의 성능시험 (국외진단제품) o 임상검체를 이용한 유용성 확인 o 임상샘플시험 결과보고서 도출
연구내용 가. 주관기관 (주식회사 시선바이오머티리얼스) : ▣ 개발키트의 최적화 o 적용 가능한 2개의 NGS 플렛폼에 대한 최적화 확립 - Life Technologies사 기반 NGS 장비에 최적화 확립 - Illumina사 기반 NGS 장비에 최적화 확립 - Cut-off 기준 (0.05% 노이즈) 0.1%의 변이 검출에 대한 재현성 분석 o 상용화를 위한 Prototype 제품 완성 - Life Technologies사 기반 NGS 장비로 분석이 가능한 prototype 제품 완성 - Illumina사 기반 NGS 장비로 분석이 가능한 prototype 제품 완성 o 임상검체를 통한 Prototype 제품의 보완작업 수행 - 제품에 대한 특이도, 민감도 부분에 대하여 수준이 미만일 경우 보정 작업 수행 - 임상검체 분석 결과를 기반으로 제품의 최적화 ▣ 개발키트 활용 시스템 구축 o 고민감도 NGS 분석 키트 활용 시스템 구축 나. 참여기관 (주식회사 파나진) : ▣ 대량생산 기술 최적화 o 표적유전자 선별 프로브 대량생산 기술 확립 - 자동합성기 도입을 통한 대량생산 플랫폼 구축 - 합성된 선별 프로브의 정제 시스템을 대량화 및 간소화하여 대량 생산에 적용 가능한 기반 구축 o 선별 프로브의 대량생산 및 SOP 확립 - 구축된 시스템들에 대한 SOP (대량 생산 SOP) 확립 - 선별 프로브 양산 다. 참여기관 ((주)인실리코젠) : ▣ 임상용 NGS플랫폼 분석 시스템 개발 o 자원변동형 클라우드 기반 NGS 분석시스템 개발 - 분석 수요에 맞춰 계산 자원을 할당하는 자원 변경형 클라우드 시스템을 개발 - 아마존, KT 등 주요 클라우드 서비스의 성능과 경제성을 검토하고 자원 변경을 위한 웹 인터페이스를 개발 - 분석 파이프라인은 디스크 이미지 형태로 패키지화하고, 클라우드에서 용이하게 탑재하고 자원 배분할 수 있도록 설계 및 구현 - 웹 인터페이스와 함께 자동화 작업을 위한 REST 인터페이스를 함께 개발하여, NGS 장비에서 곧바로 파일전송하거나, 분석 작업을 개시할 수 있도록 구현 o GridFTP 기반의 데이터 전송 모듈 개발 - NGS 장비와 클라우드간 고속의 안정된 자료 전송을 위한 데이터 전송모듈을 개발 - GridFTP 기술을 기반으로, 배치 단위로 데이터 전송 기능을 자동화함 - NGS 장비에서 REST 인터페이스를 이용하여 곧바로 데이터 전송이 가능하도록 구현 ▣ 임상활용 NGS 데이터 연계 시스템 개발 o
기대효과 o 본 사업을 추진함으로써 분석 장비 등 연구 인프라와 기반 기술을 공동으로 활용함으로써 비용을 절감하고, 연구 개발 성과를 서로 연계함으로써 R&D 사업의 시너지 효과를 거둘 수 있을 것 o 지적재산권으로 등록된 신규 진단기술의 활용과 상용화를 위하여 다양한 이종 기술 간의 융복합이 이루어져 타 산업기술 분야의 신기술 및 틈새기술을 창출을 가능하게 함 o 국가 성장 동력 10대 산업중 하나인 바이오의약/장기/의료기기 분야의 발전을 위하여 핵심 원천기술인 바이오 컨텐츠가 반드시 독창적으로 개발되어야 하며, 이를 통한 수입대체 효과 및 바이오산업 전반의 성장 촉진에 기여할 것으로 판단됨 o 기존 제품의 부가가치를 향상 시키고, 신규 산업 및 고용을 창출하여 지속적인 경제 발전을 견지 하고 국가경쟁력 강화할 수 있음 o 개발 기술이 의료산업에 적용된다면 진단 비용의 감소를 가져와 각종 질병 진단 및 치료 효과를 획기적으로 향상시켜 건강한 삶 영위할 수 있는 기회를 제공할 것 임. o 국내병원, 암센터, 암 연구소 등에서 환자의 맞춤형 암 진단 및 예후 판정등에 적용 될 것으로 기대하며 의료비 절감효과를 동반할 것임 o 본 기술개발 사업을 통해 바이오·화학합성·정보분석·임상 기관의 공동 연구가 가능하며 이에 따른 기술개발기간 단축과 경비절감, 선진 기술·제품 선점 등 의료산업의 획기적인 발전이 가능하므로, 대학 연구소 기업 전체가 동반성장할 수 있는 중요한 계기가 될 것임
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총연구비
년도 정부연구비(원) 민간연구비(원) 사업예산
2018 1,250,000,000 494,000,000 1,744,000,000